هدف از انتشار مجله پاتوبیولوژی مقایسه‌ای چاپ مقالات علمی و انتشار نتایج پژوهش‌ها و مطالعات در زمینه‌های مختلف علوم پایه و پاتوبیولوژی دامپزشکی و رشته‌های وابسته به آن است. انواع مقالات مورد پذیرش، شامل مقالات پژوهشی، مقالات تحلیلی، گزارشات درمانگاهی و آزمایشگاهی و یادداشت‌های کوتاه علمی می‌باشد. تمامی مقالات به زبان فارسی با چکیده لاتین (انگلیسی) چاپ می‌شود. مقالات نبایستی قبلاً در نشریات خارجی و داخلی  به چاپ رسیده باشند.